小學二年級的學生三木一郎有著孤獨的生活，他的父母忙於工作沒空陪他，他還有另一項苦惱就是在學校有個叫加巴拉的同學恃強而欺負他。三木靠著在夢境李來到怪獸島與哥吉拉的小孩-「迷你拉」交朋友來忘卻現實生活的痛苦。他發現迷你拉有著與他相同的煩惱，迷你拉孤獨而且常被另一隻叫加巴拉的怪獸欺侮。他與他的怪獸朋友在島上探險，見到哥吉拉與各式各樣的怪物作戰。當迷你拉回到牠的尺寸後，三木對於哥吉拉教迷你拉一些謀生技巧以及如何打敗敵人感到很有興趣。當加巴拉出現，迷你拉決定勇敢地面對牠，可是這強大的怪獸三兩下就把迷你拉打敗，迷你拉害怕得跑開了；看來三木與迷你拉有很多共同點。

    兩個脫線的強盜逃避警方追捕，跑到三木常常去玩的倉庫裡，當小孩發現了他們，他們便誘拐他把他綑綁起來。一會兒，三木睡著了。在夢境中他又來到怪獸島，迷你拉又被加巴拉打敗，這以強欺弱的怪獸雙手放出電流攻擊迷你拉。此刻，哥吉拉出現了，迷你拉跑去母親那裡尋求保護，可是哥吉拉冷酷無情地把牠推回戰場。三木在旁邊看著，迷你拉咬住加巴拉的手臂，加巴拉生氣了，可是迷你拉仗著自己體積小，逃跑囉!三木去找迷你拉，他們共同設計了項計劃。當加巴拉在大樹邊休息時，迷你拉從對面跳下到加巴拉的腳上，把牠丟向空中再打昏牠。哥吉拉為他兒子的成就感到高興。不久，加巴拉醒過來向哥吉拉攻擊，但是像任何一個仗勢欺人的人一樣，加巴拉面臨比自己強大的敵人很快便放棄而逃跑了。

    從夢裡醒過來，三木努力回想剛才迷你拉跟他說過什麼話，哥吉拉說我們必須強壯起來靠自己的力量抵抗欺負?受到怪獸朋友的啟發，三木獨自掙脫束縛並發揮驚人力量制服強盜，警方將其逮捕....三木是英雄!!下次，他再遇到真實生活中的加巴拉時，他也勇敢的對付他，三木終於贏得附近小孩的尊敬。